Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Fdft1P53798 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fdft1P53798 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms