Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Efnb1P52795 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Efnb1P52795 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Efnb1P52795 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms