Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Efna1P52793 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Efna1P52793 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Efna1P52793 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Efna1P52793 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms