Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ube2e3P52483 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ube2e3P52483 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms