Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Apobec1P51908 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Apobec1P51908 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms