Protein–RNA interactions for Protein: P51680

Ccr4, C-C chemokine receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr4P51680 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccr4P51680 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccr4P51680 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms