Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SftpdP50404 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SftpdP50404 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SftpdP50404 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SftpdP50404 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms