Protein–RNA interactions for Protein: P50283

Cd7, T-cell antigen CD7, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd7P50283 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd7P50283 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd7P50283 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cd7P50283 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms