Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Edn3P48299 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Edn3P48299 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms