Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TgfaP48030 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TgfaP48030 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms