Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt1P46096 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Syt1P46096 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Syt1P46096 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms