Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ItgavP43406 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ItgavP43406 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ItgavP43406 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 125.4 ms