Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tlx1P43345 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tlx1P43345 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms