Protein–RNA interactions for Protein: P43027

Gdf5, Growth/differentiation factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf5P43027 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gdf5P43027 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gdf5P43027 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms