Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cox6a1P43024 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms