Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NodalP43021 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NodalP43021 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NodalP43021 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NodalP43021 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NodalP43021 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NodalP43021 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NodalP43021 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NodalP43021 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NodalP43021 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms