Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Nkx1-2P42580 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nkx1-2P42580 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms