Protein–RNA interactions for Protein: P41317

Mbl2, Mannose-binding protein C, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbl2P41317 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbl2P41317 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms