Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Mmp9P41245 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mmp9P41245 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Mmp9P41245 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mmp9P41245 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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