Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Chd1P40201 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Chd1P40201 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Chd1P40201 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms