Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Traf1P39428 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Traf1P39428 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Traf1P39428 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms