Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik2P39087 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Grik2P39087 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms