Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Upk2P38575 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Upk2P38575 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms