Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ptpn1P35821 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptpn1P35821 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms