Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Stfa1P35175 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms