Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc1P34928 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc1P34928 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms