Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Tfap2aP34056 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tfap2aP34056 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms