Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Hoxc11P31313 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Hoxc11P31313 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc11P31313 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms