Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Hoxa11P31311 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxa11P31311 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms