Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hoxc10P31257 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Hoxc10P31257 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms