Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cd28P31041 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd28P31041 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cd28P31041 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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