Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccnd3P30282 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccnd3P30282 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms