Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Nedd8P29595 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nedd8P29595 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms