Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pabpc1P29341 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pabpc1P29341 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms