Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NapbP28663 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NapbP28663 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NapbP28663 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NapbP28663 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NapbP28663 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NapbP28663 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NapbP28663 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NapbP28663 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NapbP28663 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NapbP28663 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NapbP28663 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NapbP28663 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NapbP28663 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NapbP28663 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NapbP28663 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NapbP28663 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NapbP28663 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NapbP28663 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms