Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
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Hoxd10P28359 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
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Hoxd10P28359 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Hoxd10P28359 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Hoxd10P28359 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Hoxd10P28359 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Hoxd10P28359 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Hoxd10P28359 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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Hoxd10P28359 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Hoxd10P28359 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Hoxd10P28359 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Hoxd10P28359 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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Hoxd10P28359 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms