Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Apex1P28352 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apex1P28352 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Apex1P28352 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Apex1P28352 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms