Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gja4P28235 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gja4P28235 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms