Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb9P28076 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb9P28076 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms