Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CenpbP27790 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CenpbP27790 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CenpbP27790 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpbP27790 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CenpbP27790 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms