Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cd40lgP27548 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd40lgP27548 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms