Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gabra3P26049 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gabra3P26049 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms