Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm37026-201ENSMUST00000191917 535 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm7684-201ENSMUST00000211891 829 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm19231-201ENSMUST00000193212 830 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm38560-201ENSMUST00000220169 646 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 AC133517.2-201ENSMUST00000226820 690 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm7289-201ENSMUST00000168993 734 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm28721-201ENSMUST00000187649 918 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm43539-201ENSMUST00000196190 363 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gm45554-202ENSMUST00000210964 1090 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hoxd11P23813 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 4933438A12Rik-201ENSMUST00000144579 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 4930557J02Rik-201ENSMUST00000202325 1075 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm22985-201ENSMUST00000122754 116 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Hoxd11P23813 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
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