Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tsta3P23591 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tsta3P23591 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms