Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Hoxd8P23463 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Hoxd8P23463 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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