Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja1P23242 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja1P23242 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gja1P23242 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gja1P23242 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms