Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp36P22893 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp36P22893 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms