Protein–RNA interactions for Protein: P21958

Tap1, Antigen peptide transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tap1P21958 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tap1P21958 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tap1P21958 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tap1P21958 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tap1P21958 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms