Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmnb2P21619 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lmnb2P21619 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms