Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5bP21271 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Myo5bP21271 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Myo5bP21271 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Myo5bP21271 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms